Výběr materiálů pro reakční nádoby je založen na vlastnostech reaktantů a provozních podmínkách. Mezi běžné materiály patří nerezová ocel, sklolaminát-vyztužený plast (FRP) a speciální slitiny. Nerezová ocel nabízí dobrou odolnost proti korozi a mechanickou pevnost, díky čemuž je vhodná pro většinu chemických prostředí. Plasty vyztužené skelnými vlákny-se používají v aplikacích zahrnujících vysoce korozivní látky. Speciální slitiny, jako je Hastelloy, jsou vhodné do extrémních podmínek, jako jsou vysoké teploty nebo vysoce korozivní prostředí.
Při výběru materiálu hraje roli také cena. Například nerezová ocel je relativně levná, zatímco speciální slitiny jsou drahé. Výběr materiálu vyžaduje vyvážení výkonu a nákladů.
